Siekdama savo tikslų Lietuvos fiziologų draugija vykdo šią veiklą:
- Organizuoja vieną kartą metuose Draugijos visuotinius susirinkimus, konferencijas.
- Informuoja narius ir teikia jiems pagalbą dalyvaujant fiziologinio profilio tarptautinių organizacijų darbe, konferencijose ir kituose moksliniuose renginiuose.
- Palaiko ryšius su Lietuvos valstybinėmis įstaigomis ir kitomis asociacijomis bei atskirais mokslininkais.
- Atstovauja Draugijos narius tarptautinėse fiziologų organizacijose.
- Prisideda prie fiziologijos mokymo programų, vadovėlių ir mokymo priemonių rengimo, teikia metodinę ir praktinę paramą fiziologijos dėstytojams bei mokytojams.
- Organizuoja mokslines išvykas ir rengia paskaitas.
- Sudaro Draugijos nuolatinius ir laikinus padalinius darbui organizuoti.
- Kaupia Lietuvos fiziologijos istorinę medžiagą ir Draugijos archyvą.